Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ83

Mrpl55, 39S ribosomal protein L55, mitochondrial, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl55Q9CZ83 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Mrpl55Q9CZ83 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl55Q9CZ83 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl55Q9CZ83 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl55Q9CZ83 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl55Q9CZ83 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl55Q9CZ83 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl55Q9CZ83 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl55Q9CZ83 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl55Q9CZ83 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl55Q9CZ83 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl55Q9CZ83 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl55Q9CZ83 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl55Q9CZ83 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl55Q9CZ83 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl55Q9CZ83 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl55Q9CZ83 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl55Q9CZ83 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl55Q9CZ83 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl55Q9CZ83 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl55Q9CZ83 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl55Q9CZ83 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl55Q9CZ83 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl55Q9CZ83 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl55Q9CZ83 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl55Q9CZ83 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl55Q9CZ83 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl55Q9CZ83 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Mrpl55Q9CZ83 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl55Q9CZ83 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl55Q9CZ83 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl55Q9CZ83 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl55Q9CZ83 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl55Q9CZ83 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl55Q9CZ83 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Mrpl55Q9CZ83 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl55Q9CZ83 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl55Q9CZ83 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl55Q9CZ83 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl55Q9CZ83 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl55Q9CZ83 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl55Q9CZ83 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl55Q9CZ83 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl55Q9CZ83 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl55Q9CZ83 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl55Q9CZ83 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Mrpl55Q9CZ83 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl55Q9CZ83 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl55Q9CZ83 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl55Q9CZ83 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mrpl55Q9CZ83 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Mrpl55Q9CZ83 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
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Mrpl55Q9CZ83 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Mrpl55Q9CZ83 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mrpl55Q9CZ83 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mrpl55Q9CZ83 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mrpl55Q9CZ83 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mrpl55Q9CZ83 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mrpl55Q9CZ83 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mrpl55Q9CZ83 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mrpl55Q9CZ83 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mrpl55Q9CZ83 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
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