Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Khdc3Q9CWU5 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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