Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

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Length 355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atxn3Q9CVD2 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atxn3Q9CVD2 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atxn3Q9CVD2 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Atxn3Q9CVD2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atxn3Q9CVD2 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atxn3Q9CVD2 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atxn3Q9CVD2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atxn3Q9CVD2 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atxn3Q9CVD2 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atxn3Q9CVD2 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atxn3Q9CVD2 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atxn3Q9CVD2 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atxn3Q9CVD2 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atxn3Q9CVD2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atxn3Q9CVD2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atxn3Q9CVD2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atxn3Q9CVD2 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Atxn3Q9CVD2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atxn3Q9CVD2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Atxn3Q9CVD2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atxn3Q9CVD2 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atxn3Q9CVD2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atxn3Q9CVD2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atxn3Q9CVD2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atxn3Q9CVD2 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atxn3Q9CVD2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atxn3Q9CVD2 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atxn3Q9CVD2 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atxn3Q9CVD2 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Atxn3Q9CVD2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atxn3Q9CVD2 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atxn3Q9CVD2 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atxn3Q9CVD2 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Atxn3Q9CVD2 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Atxn3Q9CVD2 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atxn3Q9CVD2 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Atxn3Q9CVD2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Atxn3Q9CVD2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atxn3Q9CVD2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atxn3Q9CVD2 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atxn3Q9CVD2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atxn3Q9CVD2 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Atxn3Q9CVD2 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms