Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim8Q9CQQ0 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms