Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CQC3 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CQC3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CQC3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q9CQC3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CQC3 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9CQC3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9CQC3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9CQC3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9CQC3 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9CQC3 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CQC3 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CQC3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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