Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp2Q9CQ73 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms