Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms