Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atg3Q9CPX6 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms