Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim26Q99PN3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim26Q99PN3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim26Q99PN3 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim26Q99PN3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim26Q99PN3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim26Q99PN3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim26Q99PN3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim26Q99PN3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim26Q99PN3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim26Q99PN3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim26Q99PN3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim26Q99PN3 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim26Q99PN3 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim26Q99PN3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim26Q99PN3 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim26Q99PN3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim26Q99PN3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim26Q99PN3 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim26Q99PN3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim26Q99PN3 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim26Q99PN3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim26Q99PN3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim26Q99PN3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim26Q99PN3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim26Q99PN3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim26Q99PN3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim26Q99PN3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim26Q99PN3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim26Q99PN3 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim26Q99PN3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim26Q99PN3 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim26Q99PN3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim26Q99PN3 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim26Q99PN3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim26Q99PN3 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim26Q99PN3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim26Q99PN3 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim26Q99PN3 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim26Q99PN3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim26Q99PN3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim26Q99PN3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim26Q99PN3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim26Q99PN3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim26Q99PN3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim26Q99PN3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim26Q99PN3 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim26Q99PN3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim26Q99PN3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim26Q99PN3 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim26Q99PN3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim26Q99PN3 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim26Q99PN3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim26Q99PN3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim26Q99PN3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim26Q99PN3 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim26Q99PN3 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim26Q99PN3 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms