Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
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Ubqln4Q99NB8 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ubqln4Q99NB8 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ubqln4Q99NB8 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ubqln4Q99NB8 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ubqln4Q99NB8 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ubqln4Q99NB8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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