Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl43Q99N89 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl43Q99N89 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms