Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pramel1Q99MW3 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pramel1Q99MW3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms