Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usp11Q99K46 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp11Q99K46 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp11Q99K46 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usp11Q99K46 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usp11Q99K46 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms