Protein–RNA interactions for Protein: Q99JI4

Psmd6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd6Q99JI4 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmd6Q99JI4 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms