Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ophn1Q99J31 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms