Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rnf144aQ925F3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms