Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spdl1Q923A2 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms