Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim59Q922Y2 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms