Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Afg3l1Q920A7 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l1Q920A7 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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