Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hps3Q91VB4 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms