Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 AC154806.5-202ENSMUST00000227217 1443 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44840-201ENSMUST00000208983 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11622-201ENSMUST00000120525 691 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37502-201ENSMUST00000192981 356 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm22005-201ENSMUST00000082795 141 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 A530046M15Rik-201ENSMUST00000221778 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Npm1-204ENSMUST00000109354 1157 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm18871-201ENSMUST00000218655 745 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28438-201ENSMUST00000188299 345 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37440-202ENSMUST00000195572 1227 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 AC118006.2-201ENSMUST00000224167 962 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Manf-201ENSMUST00000069036 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms