Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCZ8

Rpusd1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd1Q8VCZ8 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd1Q8VCZ8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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