Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn4Q8VCH8 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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