Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trim29Q8R2Q0 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms