Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vmn1r200Q8R281 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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