Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc12Q8K5B8 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms