Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Casc3Q8K3W3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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