Protein–RNA interactions for Protein: Q8K310

Matr3, Matrin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 846 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Matr3Q8K310 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms