Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Polr1eQ8K202 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Polr1eQ8K202 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Polr1eQ8K202 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Polr1eQ8K202 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Polr1eQ8K202 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Polr1eQ8K202 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Polr1eQ8K202 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Polr1eQ8K202 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Polr1eQ8K202 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Polr1eQ8K202 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Polr1eQ8K202 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Polr1eQ8K202 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Polr1eQ8K202 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Polr1eQ8K202 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Polr1eQ8K202 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Polr1eQ8K202 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Polr1eQ8K202 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Polr1eQ8K202 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Polr1eQ8K202 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Polr1eQ8K202 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Polr1eQ8K202 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Polr1eQ8K202 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Polr1eQ8K202 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Polr1eQ8K202 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Polr1eQ8K202 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Polr1eQ8K202 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Polr1eQ8K202 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Polr1eQ8K202 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Polr1eQ8K202 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Polr1eQ8K202 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Polr1eQ8K202 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Polr1eQ8K202 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Polr1eQ8K202 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Polr1eQ8K202 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Polr1eQ8K202 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Polr1eQ8K202 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Polr1eQ8K202 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Polr1eQ8K202 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Polr1eQ8K202 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Polr1eQ8K202 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Polr1eQ8K202 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Polr1eQ8K202 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms