Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FgbQ8K0E8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FgbQ8K0E8 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms