Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW8

Pnma3, Paraneoplastic antigen Ma3 homolog, mousemouse

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Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma3Q8JZW8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnma3Q8JZW8 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnma3Q8JZW8 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnma3Q8JZW8 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnma3Q8JZW8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnma3Q8JZW8 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnma3Q8JZW8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnma3Q8JZW8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnma3Q8JZW8 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnma3Q8JZW8 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnma3Q8JZW8 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnma3Q8JZW8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnma3Q8JZW8 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnma3Q8JZW8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnma3Q8JZW8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnma3Q8JZW8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Pnma3Q8JZW8 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnma3Q8JZW8 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnma3Q8JZW8 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnma3Q8JZW8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnma3Q8JZW8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnma3Q8JZW8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnma3Q8JZW8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnma3Q8JZW8 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnma3Q8JZW8 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnma3Q8JZW8 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnma3Q8JZW8 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnma3Q8JZW8 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnma3Q8JZW8 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnma3Q8JZW8 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnma3Q8JZW8 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnma3Q8JZW8 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnma3Q8JZW8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnma3Q8JZW8 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pnma3Q8JZW8 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pnma3Q8JZW8 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pnma3Q8JZW8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pnma3Q8JZW8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pnma3Q8JZW8 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pnma3Q8JZW8 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pnma3Q8JZW8 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pnma3Q8JZW8 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pnma3Q8JZW8 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pnma3Q8JZW8 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pnma3Q8JZW8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pnma3Q8JZW8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Pnma3Q8JZW8 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pnma3Q8JZW8 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
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Pnma3Q8JZW8 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pnma3Q8JZW8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pnma3Q8JZW8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Pnma3Q8JZW8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pnma3Q8JZW8 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pnma3Q8JZW8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Pnma3Q8JZW8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Pnma3Q8JZW8 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnma3Q8JZW8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Pnma3Q8JZW8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnma3Q8JZW8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnma3Q8JZW8 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnma3Q8JZW8 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Pnma3Q8JZW8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnma3Q8JZW8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnma3Q8JZW8 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnma3Q8JZW8 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnma3Q8JZW8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnma3Q8JZW8 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnma3Q8JZW8 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnma3Q8JZW8 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnma3Q8JZW8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnma3Q8JZW8 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnma3Q8JZW8 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnma3Q8JZW8 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnma3Q8JZW8 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnma3Q8JZW8 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pnma3Q8JZW8 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pnma3Q8JZW8 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pnma3Q8JZW8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pnma3Q8JZW8 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pnma3Q8JZW8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms