Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZS7

Hmgcll1, 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgcll1Q8JZS7 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Hmgcll1Q8JZS7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Hmgcll1Q8JZS7 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Hmgcll1Q8JZS7 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Hmgcll1Q8JZS7 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hmgcll1Q8JZS7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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