Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc4a8Q8JZR6 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms