Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Ercc8Q8CFD5 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Ercc8Q8CFD5 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Ercc8Q8CFD5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Ercc8Q8CFD5 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Ercc8Q8CFD5 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Ercc8Q8CFD5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ercc8Q8CFD5 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Ercc8Q8CFD5 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Ercc8Q8CFD5 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Ercc8Q8CFD5 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Ercc8Q8CFD5 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Ercc8Q8CFD5 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Ercc8Q8CFD5 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ercc8Q8CFD5 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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