Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdkl1Q8CEQ0 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cdkl1Q8CEQ0 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cdkl1Q8CEQ0 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cdkl1Q8CEQ0 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms