Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc38Q8CDN8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc38Q8CDN8 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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