Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc87Q8CDL9 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms