Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Usp20Q8C6M1 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Usp20Q8C6M1 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Usp20Q8C6M1 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Usp20Q8C6M1 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Usp20Q8C6M1 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Usp20Q8C6M1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Usp20Q8C6M1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Usp20Q8C6M1 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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