Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssuh2Q8C3L1 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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