Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Usp38Q8BW70 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp38Q8BW70 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp38Q8BW70 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp38Q8BW70 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp38Q8BW70 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp38Q8BW70 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp38Q8BW70 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp38Q8BW70 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp38Q8BW70 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp38Q8BW70 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp38Q8BW70 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp38Q8BW70 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp38Q8BW70 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Usp38Q8BW70 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp38Q8BW70 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Usp38Q8BW70 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Usp38Q8BW70 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp38Q8BW70 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp38Q8BW70 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp38Q8BW70 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp38Q8BW70 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp38Q8BW70 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Usp38Q8BW70 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp38Q8BW70 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Usp38Q8BW70 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Usp38Q8BW70 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Usp38Q8BW70 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp38Q8BW70 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Usp38Q8BW70 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp38Q8BW70 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp38Q8BW70 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp38Q8BW70 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp38Q8BW70 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp38Q8BW70 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp38Q8BW70 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp38Q8BW70 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp38Q8BW70 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp38Q8BW70 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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