Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pdcl3Q8BVF2 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms