Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmod1Q8BVA4 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmod1Q8BVA4 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmod1Q8BVA4 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmod1Q8BVA4 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmod1Q8BVA4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmod1Q8BVA4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmod1Q8BVA4 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmod1Q8BVA4 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmod1Q8BVA4 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmod1Q8BVA4 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmod1Q8BVA4 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmod1Q8BVA4 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmod1Q8BVA4 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmod1Q8BVA4 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmod1Q8BVA4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmod1Q8BVA4 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmod1Q8BVA4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmod1Q8BVA4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmod1Q8BVA4 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmod1Q8BVA4 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmod1Q8BVA4 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmod1Q8BVA4 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmod1Q8BVA4 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmod1Q8BVA4 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmod1Q8BVA4 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmod1Q8BVA4 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmod1Q8BVA4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmod1Q8BVA4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmod1Q8BVA4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmod1Q8BVA4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms