Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gpc2Q8BKV1 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms