Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Smarcal1Q8BJL0 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Smarcal1Q8BJL0 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Smarcal1Q8BJL0 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Smarcal1Q8BJL0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Smarcal1Q8BJL0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcal1Q8BJL0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms