Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII3

D130040H23Rik, RIKEN cDNA D130040H23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130040H23RikQ8BII3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
D130040H23RikQ8BII3 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
D130040H23RikQ8BII3 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
D130040H23RikQ8BII3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
D130040H23RikQ8BII3 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
D130040H23RikQ8BII3 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
D130040H23RikQ8BII3 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
D130040H23RikQ8BII3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
D130040H23RikQ8BII3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
D130040H23RikQ8BII3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
D130040H23RikQ8BII3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
D130040H23RikQ8BII3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
D130040H23RikQ8BII3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms