Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ubash3bQ8BGG7 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubash3bQ8BGG7 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms