Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8BGC1 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8BGC1 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8BGC1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8BGC1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Q8BGC1 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q8BGC1 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q8BGC1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q8BGC1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q8BGC1 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q8BGC1 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q8BGC1 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms