Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smim19Q80ZU4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim19Q80ZU4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.7 ms