Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcsk9Q80W65 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms