Protein–RNA interactions for Protein: Q80U30

Clec16a, Protein CLEC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,036 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec16aQ80U30 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Clec16aQ80U30 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Clec16aQ80U30 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Clec16aQ80U30 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Clec16aQ80U30 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clec16aQ80U30 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms